Après un mystérieux cataclysme d'ampleur mondiale - le Changement -, six personnes reviennent à elles dans les sous-sols d'un centre de recherche. Elles n'ont aucun lien entre elles et ne sont jamais vues. Rapidement, elles apprennent qu'elles font partie d'une expérience scientifique baptisée « Extinction », dont l'objectif est de sauver la race humaine. Mais que cache au juste ce projet ? Et les six cobayes sont-ils bien ce qu'ils affirment être ?
Professionnellement, tout réussit au docteur Maya Young. Jusqu'au jour où, après une séance de sport particulièrement intense, Maya commence à tousser et à cracher du sang. À l'hôpital, elle découvre que ses symptômes sont bien plus complexes qu'elle ne le pensait. Et sa maladie pourrait être liée à une conspiration d'envergure...
Owen Watts est un pompier en passe de perdre son emploi. Une intervention de routine va tout faire basculer. Si cet appel semble être une fausse alerte, il n'en est rien : c'est le point de départ du Changement. Une nouvelle ère pour l'humanité...
Tandis que l'implacable phénomène déferle sur le globe, Owen et Maya se réveillent dans un centre de recherche en compagnie de quatre inconnus. On ne leur dit rien, si ce n'est qu'ils font partie d'une expérience scientifique conçue pour permettre à l'humanité de survivre après le Changement.